Python生物信息从入门到进阶钻研会12月培训班
聚会先容
聚会内容 主理方先容
Python生物信息从入门到进阶钻研会12月培训班宣传图
生物信息从入门到进阶钻研会
2022年12月2-4日 腾讯聚会网络聚会室
【课程靠山】Python是一种连系注释性、编译性、互动性和面向工具的剧本语言。它设计精练，具有很强的可读性。Python现在拥有众多专用的科学盘算扩展库，以及生物信息学专用的Biopython，为剖析处置生物信息学数据提供了壮大功效。越来越多的科研职员最先学习Python语言用于机械深度学习，来处置实验数据、制作图表。
【课程特色】
1. 本课程笼罩python基础知识，通过atom程序编辑软件举行python程序写作。
- Deep learning,决议树，支持向量机，神经网络
3. Github程序库先容，Git使用下载、上传、协作软件编辑，
4. Python基本软件包Numpy、Pandas、Matplotlib、SKlearn及磁共振软件包nibabel先容
5. 本课程手把手，实操性强，有全程屏幕录制视频课后发给学员，组群学员微信群便于学员与讲师互动交流
【讲师靠山】
专家，博士生导师。研究偏向生物物理、生物光子学、生物医学虚拟场景开发。05获中科院分子发育生物学硕士学位，08年获美国东北大学物理化学硕士学位，13年获美国密苏里大学哥伦比亚生物物理博士学位与统计硕士学位，13-18年在加州大学伯克利分校博士后。现在已在Cell,Nature Communications,EMBO reports，ACS Sensors等杂志揭晓文章十余篇。
【主要内容】详细内容见课表
Git软件使用、Python编程详解
【学习目的】
通过学习，让学员掌握：Git、Atom的基本使用、python数据结构；python的输入输出、方程、模块、循环、算法、寻找bug；python常见软件包numpy、pandas、matplotlib、SKlearn、nibabel等安装使用及软件包功效先容；通过python举行小的数据、图像、数学、统计盘算剖析;python深度学习先容，人工智能训练线性及卷积神经网络。
以下为详细日程：
Python学习班课程放置 |
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日期 |
时间 |
主要内容 |
详细内容 |
备课 |
19:00-20:30 |
软件安装 |
Git、Atom、Python安装 |
第一天上午 |
9:00-10:30 |
盘算机语言基本先容 |
盘算机语言先容、差异语言对照、Python的优瑕玷、Github先容 |
程序的组织与写作、Git先容 |
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基本数学盘算、变量、字符、文字 |
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交互式输入与输出、上载与下载文件 |
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10:30-10:45 |
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10:45-12:00 |
盘算机语言数据结构与逻辑教学 |
交互式输入与输出、上载与下载文件 |
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循环与逻辑 |
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数据结构：序列和字典 |
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12:00-13:00 |
午休时间 |
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第一天下昼 |
13:00-15:30 |
编程基本解说与Python软件包教学 |
面向工具编程 |
模块、类与工具 |
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Python软件包，若何制作并使用 |
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Debugging、自测试 |
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15:30-15:45 |
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15:45-18:00 |
基本程序写作及网络数据挖掘写作 |
Python统计盘算，均值、方差、t统计、p值、pdf和cdf统计漫衍图 |
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基本网络数据挖掘写作 |
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第二天上午 |
9:00-10:30 |
Matplotlin软件包及实操（一） |
Matplotlin软件包先容 |
现状图、柱形图、散点图、 |
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轮廓图、图像保留 |
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一样平常图像的输入、输出 |
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10:30-10:45 |
休息 |
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10:45-12:00 |
Matplotlin软件包及实操（二） |
矩阵基础、数字图像是什么？ |
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基本图像数字处置、平移、缩放、旋转 |
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Affine转化、图像切割、多图绘制 |
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12:00-13:00 |
午休时间 |
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第二天下昼及晚上 |
13:00-15:30 |
Numpy软件包先容及实操（一） |
Numpy软件包先容、数组属性 |
确立数组、数值性子、切片索引 |
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高级索引 |
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15:30-15:45 |
休息 |
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15:45-18:00 |
Numpy软件包先容及实操（二） |
广播、数组迭代 |
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数组操作、位运算、字符串函数 |
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数学函数、统计函数、基础统计先容 |
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矩阵库、线性代数运算 |
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18:00-19:00 |
晚饭及休息时间 |
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19:00-22:00 |
mxnet软件包先容及实操 |
线性神经网络、softmax回归 |
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图像分类MNIST |
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多层感知机 |
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深度学习盘算，卷积神经网络 |
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第三天上午 |
9:00-10:30 |
Pandas软件包先容及实操 |
Pandas软件包先容 |
选择数据、设置值处置、数据丢失、合并出图 |
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全基因组sgRNA数据的剖析、sgRNA序列提取、GC含量、sgRNA位置信息提取、sgRNA序列比对 |
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10:30-10:45 |
休息 |
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10:45-12:00 |
Biophython软件包先容及实操 |
基因序列治理、比对 |
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DNA序列转录、翻译 |
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多序列比对、序列输入输出 |
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Nibabel软件包及实操 |
Nibabel软件包先容 |
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磁共振MRI数据读取 |
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矩阵提取、效果可视化、运动矫正、线性回归 |
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磁共振MRI数据读取 |
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12:00-13:00 |
午休时间 |
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第三天下昼 |
13:00-15:00 |
Scikit learn软件包及实操 |
矩阵提取、效果可视化、运动矫正、线性回归 |
线性回归 |
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分类、无监视 |
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数据降维、数据预处置、PCA、K-means、支持向量机SVM、决议树 |
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15:00-15:15 |
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15:15-17:00 |
Tensorflow深度学习先容 |
卷积、正向反向流传、优化器、损失函数、池化、BN |
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LeNet, AlexNet, VGGnet, Inception, ResNet网络先容与应用 |
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图网络与超图网络先容 |
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备注：务必自带电脑，要求windows系统，有大于50G可用内存。学习班可提供安装包 |
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医药加金牌学习班特色：
医药加金牌学习班自2017年1月正式开办以来，已经乐成举行了千余期，培训了天下（原谅港、澳、台区域）及加拿大、丹麦、澳大利亚等国家跨越千家科研单元的近万名学员。优越的课堂气氛和讲师耐心的课后跟进，获得了学员的交口赞美。医药加金牌学习班，是让学员们真正能够学以致用，在科研上更上一层楼的学习班。
学习班教学宗旨：教得多，讲得精，学得会，用得上。
讲师团队：医药加金牌学习班所有讲师都来自于科研一线，博士以上学历，高级职称，具有厚实的实战履历和授课履历，保障了学习班的内容的适用性、意见意义性。
课程内容：课程内容为讲师亲自设计，以科研事情者亲身需求为起点，将课程偏向与当前热门完善连系。全程纯干货、无套路。
课堂效果：小班制教学，讲师面劈面授课，互动性强，答疑时间足够，有问题现场解决。上课PPT完全拷给学员。
课后保障：组建耐久微信群，讲师与学员可耐久互动。也利便学员之间联系，举行横向相助。领会最新课程放置。
现实效果：许多上过学习班学员，已经反馈乐成揭晓文章，基金中标。
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